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世界首个野生梨基因组图谱完成

导读 : 本报讯(记者黄哲雯)记者获悉,中国农科院果树研究所研究员曹玉芬团队与中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队,日前合作组装了高质量的杜梨参考基因组序列&...


  本报讯(记й者黄▀哲雯)记者获悉,中国农科院果树研究所研И究员曹玉芬团队与中▁▂▃▄国科学院遗传与发育生物学研究所¤研究员田志喜团队,日щⅠ前合作组装了高质量的杜梨参┍考基因组序列—$—这是世界首个野生梨的基因组图谱,也是我国在梨基因组学研究领域又一重大研究进展。

  该基因组的公布丰富了梨属植物ξ基因组信息,同时将为梨基因组研究、功能基因挖掘、梨属植物驯化⿷以及野*生资源利用提供重要保障。

  据曹々玉芬团队介绍,科研人员以山西杜梨√为☺☻材料,结合ΣPacBio三代测序、B¤ionano光学图谱、Hi-C技术,组装了高质量的杜梨参考基因◆组序列。≯具体来看,杜梨基因组组装∧┓大小为532.7兆,contig N50为1.57φ兆,共有5∣9∵▂▃▅▆█552个蛋白质编码基因和247.4兆重复序列被∮注释,∩通过BUSCO对基因组完整性进Θ行评估◁,完整性达到95.9%。

 ● ⊙研究认为,杜梨扩张基因在次生代谢通路中显著富集,可能进而影响杜梨⊥较强的逆境⇔适应性。分析结果ō显▐示Б▧,驯⌒化过程℉中,东方梨▫的果实大小、糖代谢和转运,以及光۩合效率受到◄正向选择。 ┘

  研究цↆ同时发※现『,梨属植物在驯化过程中果实酸涩味逐渐消失。◥杜梨原花青素合成结构基因拷贝数显著多于白梨,影响了原花青素的积累,同时花青素▓还原酶代谢途径是原花青素合成的唯一途径,山梨醇转运蛋白跨膜转运可能是影响可溶性有机物质积累的主要々因素。


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